胃肠肿瘤中心一病区是北京肿瘤医院以胃癌、结肠癌和直肠癌诊治为主的外科临床科室。1976年建所初期成立的肿瘤外科腹部外科专业组即为现在胃肠肿瘤中心一病区的前身，是肿瘤研究所成立初期几个主要病种防治研究专业之一。
胃肠肿瘤中心一病区现有病床33张，医护人员37名，其中主任医师4人，副主任医师2人，主治医师5人，住院医师8人，护士18 人。学科带头人季加孚教授，科室副主任李子禹教授，任晖任护士长。
医疗特长及优势：以患者的个体化为宗旨，积极推广胃肠肿瘤的规范化手术，重视综合，提倡人性化服务。胃癌的标准D2根治手术、围手术期综合、胃肠道肿瘤微创手术、胃肠道肿瘤的腹腔镜探查术、胃癌手术中的纳米碳淋巴结示踪技术、早期胃癌的EMR/ESD内镜下、腹腔热灌注化疗及直肠癌的术前放疗等已成为科室特色的常规手段。
现科室年门诊量近13000人，病房年收治患者近1300人，手术量近800台。其中胃癌患者约占2/3，结直肠癌患者约占1/3。规范细致的手术操作、合理的综合、丰富的病例管理经验和人性化的护理是患者疗效为可靠的保障。
北京大学肿瘤医院胸部肿瘤内一科（原胸部肿瘤内科）是以肺癌诊治为主、具有深厚沉淀、传承并不断发展的研究型临床专科，多年来一直致力于中晚期肺癌规范化、个体化内科和多学科综合及相关转化研究。现有病床36张，医护人员30名。10名医生中高级职称医师6名，中级职称医师3名，初级职称医师1名，几乎所有医生均具有硕士或博士研究生学历，3人具有国内外博士后研究经历。护士队伍中，主管护师4名，护师8名，本科及以上学历8名。共同组成一支高素质、高学历、具有丰富临床和研究经验、充满蓬勃朝气和积极进取的医护团队，医教研综合实力达国内水平。
消化肿瘤内科专注于胃肠道肿瘤的，以临床研究推进临床实践，以人才培养带动学科发展。专长于胃癌、结直肠癌、食管癌、胰腺癌、胃肠间质瘤、神经内分泌肿瘤、胆道肿瘤、肝癌等，以及难治性消化系统肿瘤的诊断与、综合及个体化。消化肿瘤内科拥有60多张病床，2013年接诊3万余人次。患者来自全国各地以及海外。科室专业技术实力雄厚，特别在胃癌、食管癌等中国高发肿瘤以及结直肠癌的，我们积累了丰富的经验，水平居于国内地位，病人在这里能享受到的医疗服务、的策略与方案。我们还为国内各大肿瘤专科医院培养了数百人的研究生及进修医生，推动了国内消化道肿瘤的规范化。同时我们基于临床问题开展的临床研究，以及牵头承担的数十项国家、省市级科研项目，提升了国内整个临床水平，促进了学科发展。
北京大学肿瘤医院黑色素瘤与肉瘤内科，始建于2005年，通过十余年的快速发展，科室具有强大的医疗科研团队，开设本院、南院共两个病区，以及临床转化实验室。年门诊量30000余人次，收治患者8000余人次。全科在编医生10名，研究人员2名, 合同医生1名，在编均为博士学位,其中主任医师4名，副主任医师4名，研究员1名，副研究员1名。学科带头人郭军主任，任Melanoma World Society (MWS) 副主席及中国临床肿瘤学会(CSCO)副理事长兼秘书长等职务。科室多人数次获得，市级人才培养计划。近年留学回国青年医师7人，与多家国际黑色素中心建立良好合作。