运价比较高
由于航空货运的技术要求高、运输成本大等原因，使得它的运价相对来说比较高。所以价值比较低、时间要求不严格的货物，通常在考虑运输成本问题的基础上，而选择其他运输方式
载量有限
由于飞机本身的容积及设计的装载重量限制，对大件货物或大批量货物的运输造成了一定的影响
易受天气影响
航空运输受天气影响非常大，如遇到大雨、大风、大雾等恶劣天气，航班就不能得到有效的保证，就会引发航空货物运输不正常的情况
组织形式
邮政运输的传统操作理论是接力式传送。航空快递公司则大多都采用中心分拨理论或称转盘分拨理论组织起全球的网络。简单来讲就是快递公司根据自己业务的实际情况在中心地区设立分拨中心（Hub）。各地收集起来的快件，按所到地区分拨完毕，装上飞机。当晚各地飞机飞到分拨中心，各自交换快件后飞回。第二天清晨，快件再由各地分公司用汽车送到收件人办公桌上。这种方式看上去似乎不太合理，但由于中心分拨理论减少了中间环节，快件的流向简单清楚，减少了错误，提高了操作效率，缩短了运送时间，被事实证明是经济、有效的。
集中托运
集中托运(Consolidation)可以采用班机或包机运输方式，是指航空货运代理公司将若干批单独发运的货物集中成一批向航空公司办理托运，填写一份总运单送至同一目的地。这种托运方式，可降低运费，是航空货运代理的主要业务之一。
一般规定
1. 托运货物时应检查托运人的有效身份证件。按要求写货物托运书，明确是否保险，是否填写声明价值，并由托运人接货人双方签字或盖章。
2. 托运人对托运书的真实性，准确性负责。
3. 托运政府限制运输及需要向公安，检疫等政府部门办理有关手续的货物，应随附有效证明。
4. 运输条件不同或性质相互对立的货物，应分别办理托运手续。
5. 货物包装应适合航空运输的要求，严禁用草袋包装和草绳捆扎。