预付款保函的种类
保函种类主要有以下五种：
种是预付款保函、有称还款担保是指向受益人保证，如申请人没有按时预付款，则银行负责返还担保函规定的金额。预付担保的金额不超过承包人收到工程预付金额。
第二种是投标保函、是向受益人作出保证，在申请人报价的有效时间内，投标人不可车标、改标、更改原报价条件，应遵守其诺言，并且一旦中标后，要在规定的时间内和招标人签订合同，如果招标人违约，银行将子啊担保额度的范围内向招标人支付金额，投标人报价总额的1%-5%不等。
第三种是履约保函、是指应劳务方和申请人的要求，向工程的受益人所作出的一种保证承诺。
第四种是质量保函、是指申请人的请求，向受益人保证，在工程质量不符合合同规定，申请人又不能维修时，由农业银行按担保函规定金额赔付工程业主。该款项通常为合同价款的5%-10%。
第五种是临时进口设备再出口保函、按国际工程承包惯例，凡承包商为施工而临时进口的机械设备可免关税，但完工以后，用于施工临时进口设备必须如数再运出工程所在国。
预付款保函扣除
当申请人未能向受益人履行合约，则银行将代替申请人向受益人支付预付款，同时，申请人在银行购买的此项服务终止，预付款保函失效。
预付款保函是合同乙方保证自己收入的一种手段，这种保障手段多出现在工程中，为了保障合同双方平等，若有条件，甲方都应该先申请办理预付款保函，目的是为了在项目结束时，如果自己没有能力完成和合同约定的条款，将由银行出面，将甲方事先支付的预付款付给乙方，保证乙方的权益不受损失。当银行履行完此项业务时，预付款保函扣除。
预付款保函,又称还款保函，指担保人(银行)根据申请人(合同中的预收款人，通常情况下是出口商)的要求向受益人(合同中的预付款人，通常是进口商)开立的，保证一旦申请人未能履约，或者未能全部履约，将在收到受益人提出的索赔后向其返还该预付款的书面保证承诺。
从预付款保函和履约保函的定义中可以得出，不管是预付款保函还是履约款保函二者的终目的是一样的，都是为了程度的保护业主的权益。预付款保函和履约保函的区别主要在于担保的期限时间长短不同，前者较长而后者一般较短，现实中有的可能指存在其中的一个，这是大家视具体情况作出选择，学会灵活的运用。