区分商业保函和银行保函就看该保函是谁出具的，即有相关机构的公章及相关代表人签字。
工程担保的主体分为:受益人，保证人及被保证人。受益人就是保函开给谁，谁就是受益人，保证人一般是开具保函方，被保证人就是谁申请出具保函，谁就是被保证人。
在中国，保函一般都是银行或者相关金融机构如担保公司等出具保函。由担保公司出据的保函，称为商业保函；银行出具的保函，称为银行保函。
银行保函的办理流程：
1、填写开立保函申请书并签章；
2、提交保函的背景资料，相关的保函格式并加盖公章，企业近期财务报表和其它有关证明文件；
3、落实银行接受的担保；
4、由银行审核后对外开出保函。
银行保函一般用于工程行业，建工企业，工程建造的时候，为了防止双方违约或者是出现别的问题。银行保函又被叫做银行保证书、银行信用保证书简单来说就是保证书。银行保函指的是银行应委托人的申请而开立的有担保性质的书面承诺文件，一旦委托人未按其与受益人签订的合同偿还债务或履行约定义务，那么这时就会由银行履行担保责任。
农民工工资保函是指保函机构应申请人要求，保证其在生产建设的过程中或依据项目工程所在地相关部门要求，按规定时间、按规定金额向参与项目生产、工程建设的施工建设人员支付工资的保证文书。