进料加工贸易的进口，其大体的程序差不多。不同的是要先办手册。（关于手册的办理有空再另辟主题）分为进料加工手册和来料加工手册。报关的时候要用加工贸易的手册，再加上一般贸易几口所需的资料进行报关。
再就是缴关税，因为有手册，所以如果你进口的货物是免税的，只缴保证金，有的是需要缴全额的也就是的保证金，有的只缴100元的保证金。这些保证金等你的手册上面的所有进口料件核出口成品都出完了，那就要核销，核销完了你缴的保证金会一分不少的退回给你。和一般贸易所交的关税的操作程序一样。只不过一个是关税，一个是保证金。
接货：进口商或国外公司以电话或传真通知进口部人员货物即将入关，操作人员派车到进口商处提取清关文件。委托人应当向货运代理提供所委托报关事项的真实情况。
报关：报关员在接到清关文件后先行审核，审核无误后交由海关进行清关。
出税：在海关审核无误后，将会自动打出一份进口关税税单和增值税税单，由客户直接交纳税金，或由货运代理代垫税金。进口转关货物，按货物运抵指运地海关之日的汇率和税率征税。
此外，进口商应注意货物的申报期。海关规定，进口货物应自运输工具进境之日起l4日内办理申报。如逾期申报，海关则自第l5日起按到岸价每日征收0．05%的滞报金。如超过3个月仍未申报，海关即变卖货物，在扣除各种费用后，余款上缴国库。
进口报关是履行海关入境手续的必要环节之一。进口报关严格按照国家法律要求进行相关操作，需要明确相关资料等。进口报关是指收货人或其代理向海关申报进口手续和缴纳进口税的法律行为。海关根据报关人的申报，依法进行验关。海关经查验无误后，经收货人或其代理缴纳相关税款后，才能放行。