将传统的化粪池连接沼气净化池，粪便污水由沼气净化池处理，所产生的沼气供公厕管理人员作生活燃料，废液作为厕所屋顶、墙面、周围环境绿化及种菜的有机肥料，具有粪便处理效果好、综合利用废料、使用方便、环境优美、经济效益、环境效益和社会效益显着等优点。
若要保证化粪池的正常运行，化粪池沉积到一定的时间后，要及时的进行清渣的话，否则将会导致，化飞驰的污泥在池底，而使粪池的有效容积日益的减少，也能起到减少环境污染的作用。因此，化粪池要在3到12个月及逆行那个一次清理。
三格式化粪池是由三个相互连通的密封粪池组成，粪便由进粪管进入池依此顺流至第三池，其各池的主要原理：
池：
主要截留含虫卵较多的粪便，粪便经发酵分解，松散的粪块因发酵膨胀而浮升，比重大的下沉，因而形成上浮的粪皮、中层的粪液和下沉的粪渣。利用寄生虫的比重大于粪尿混合液的原理使其自然沉降于化粪池底部。利用粪液的浸泡和翻动化解粪块使其液化并截留粪渣于池底。厌氧发酵：化粪池的密闭厌氧环境，可以分解蛋白性有机物，并产生氨等物质，这些物质具有杀灭寄生虫卵及病菌的作用。
第二池：
起进一步发酵、沉淀作用，与池相比，第二池的粪皮和粪渣的数量减少，因此发酵分解的程度较低，由于没有新粪便的进入，粪液处于比较静止状态，这有利于漂浮在粪池中的虫卵继续下沉。
第三池：
主要起储存粪液的作用。经前二格处理的粪液进入第三池，基本上已经不含寄生虫卵和病原微生物，达到了粪便无害化要求，可以供农田直接施肥。
如果化粪池处于长期不清理状态，会造成粪渣板结，化粪池实则形同虚设，污物得不到有效的无害化处理，将直排市政渠。此外，在污水井密封程度较高的情况下，如果沼气满溢，甚至可能造成沼气爆炸，这也就是为什么要定期进行化粪池清理的原因所在。